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Behar, R., Grima, P. & Marco-Almagro, L. (2013) Twenty-five analogies for explaining statistical concepts. American Statistician, 67, 44-48. 統計学を教えるための25のたとえ話，原文は読んでないけど，おもしろい。50%の信頼区間の話とかあーそう…
Gerber, B., Ivan, J. & Burnham, K. (2014) Estimating the abundance of rare and elusive carnivores from photographic-sampling data when the population size is very small. Population Ecology, 1-8. CSUに居たときに，たまに会って挨拶してたBrian…
概念としては，林さんのこのブログが便利なのですが，で，結局両方ともどうやって計算しているの，というのを確かめる機会があったので，以下にメモとして。ここを参考にしただけなので，本サイトを読んでもらった方が良いです。しかし，予測の信頼区間が回…
drm*1を使って濃度反応関係を推定し，その結果からED*2を使って，x%の影響が予測される濃度を推定するというのは，多分このパッケージを使う人の多くがやることだと思う。そこでの注意点は，drm(..., fct=W1.4)とかdrm(..., fct=LL.4)のパラメータ4つのモデ…
伝えるための心理統計: 効果量・信頼区間・検定力作者: 大久保街亜,岡田謙介出版社/メーカー: 勁草書房発売日: 2012/01/26メディア: 単行本購入: 9人 クリック: 164回この商品を含むブログ (13件) を見るHYSさんから教えてもらった本。第一章「心理統計にお…
Olden, J.D., Lawler, J.J. & Poff, N.L. (2008) Machine learning methods without tears: A primer for ecologists. Quarterly Review of Biology, 83, 171-193. 涙なしの機械学習：生態学者への入門書。という大変キャッチーなタイトル。Oldenさんと会っ…
EFSA Scientific Committee (2009) Guidance of the Scientific Committee on a request from EFSA on the use of the benchmark dose approach in risk assessment. The EFSA Journal, 1150, 1–72. http://www.efsa.europa.eu/en/efsajournal/pub/1150.htm …
AICで総当たりによるモデル比較（選択）みたいなのは，MuMInが便利そう。結構な組合せでも落ちずに，Akaike weightや説明変数の相対的な重要性*1を計算してくれるよう。単に総当たりしてモデルを結果を見たい場合も，これはかなり便利そう。最近，解析を始め…
Hastie, T. & Fithian, W. (2013) Inference from presence-only data; the ongoing controversy. Ecography, 36, 864-867. タイトル見ただけ。おもしろそうなんだけど，ボクには読めない*1。 *1:でも，こういう解析は今のところしていないから，とりあえず…
Masicampo, E.J. & Lalande, D.R. (2012) A peculiar prevalence of p values just below .05. Quarterly Journal of Experimental Psychology, 65, 2271-2279. KSYさんのサイトより。心理学系の論文誌3つから，報告されているp値を集めてくると，よく使われ…
Trögl, J., Benediktová, K., Pilařová, V. & Synek, V. (2013) A single-parameter logistic equation for fitting concentration-response curves from standard acute ecotoxicity assays. Environmental Toxicology and Chemistry, 32, 2412-2416. EC50…
Mixturesと混合モデルという検索では，Chris Genningsさんの仕事がひっかかってくる。人健康の枠だとは思うんだけど，SASで，0〜100%の応答のものに，nonlinear mixed modelを使っている模様。Gompertz modelを使うと，どうやら変数を線形モデルみたい（例え…
サンプル数はダメで，サンプルサイズが正しいというのを，林さんのところで見つけて，ここを読んで見たけど，なんでダメなのかよくわからなかった*1。でも，ボクはサンプルサイズと書いた気がする！と思って，先日出た環境毒性学会誌の解説論文を見たら，見…
Isnard et al. (2001) Statistical analysis of regulatory ecotoxicity tests. Chemosphere, 45, 659-669. Moore & Caux (1997) くらいしか，NOECやLOECが対応する影響サイズを報告した論文を知らなかったのですが，これもその手の論文の一つ（27の慢性毒性…
西田高志, 門田克行 & 中村亜希子 (2011) 排水の生物影響評価に用いる統計手法の比較・検証. 環境毒性学会誌, 14, 119-126. 金属毒性の特集号に載っていた論文。WETのデータを使ったNOECとIC25の比較がある。Steel's testとDunnett's testで異なる結果を出し…
Sanchez, G. 2013. PLS Path Modeling with R. http://www.gastonsanchez.com/PLS_Path_Modeling_with_R.pdf NSNさんに依然教えてもらったやつ。ふと目についたので，眺めてみたけど，2章までさらっと読めた。次の章は，メソッド的なところなので難しそうだ…
SETACヨーロッパの年会（5/12-16）に行ってきたので，簡単に感じた事などをまとめておきたいと思います。ただ，いずれもメモ程度であるということ，内容をきちんとボクが把握できているかという点と，あくまで口頭またはポスター発表での内容を参照している…
環境毒性学会誌に資料・報告として，以下のタイトルの原稿が載ることになりました*1。エコリスク通信に書いたネタの続き的ではあるのですが，NOEC, LOEC問題について，簡単に整理して解説記事？を書きました。英語ではIEAMやET&Cを中心に沢山論文はあります…
はてなブックマークランキングであの林先生の記事が1位！ http://b.hatena.ne.jp/ranking/weekly/20130415/knowledge ちゃんと読んでないのですが，このネタ，講義で使えそうな気がする。ちょっと考えてみよう。
統計学が最強の学問である作者: 西内啓出版社/メーカー: ダイヤモンド社発売日: 2013/01/24メディア: 単行本（ソフトカバー）購入: 11人 クリック: 209回この商品を含むブログ (129件) を見るえらくたいそうなタイトル。中身としては，主にビジネス想定の統…
多重比較のREGWQ*1をRでしたいばあいは，mutossというパッケージのregwqという関数がある模様*2。multcompは，GLMに使えるけど，多分この関数はLMしばりだと思う。 *1:ネットでちょっと検索しただけですが，Ryan, Einot, Gabriel, Welch q testが略記のもと…
某国際誌*1の査読を大分前にして，その論文が受理されたとの連絡を先日もらった*2。ボクのコメントに著者がどう対応しているか知りたかったので，ハンドリングエディターに，著者のレスポンス見せてもらえますか？と言ったら送ってくれた（そういう意味では…
Excelで学ぶ共分散構造分析とグラフィカルモデリング作者: 小島隆矢出版社/メーカー: オーム社発売日: 2003/12/01メディア: 単行本購入: 13人 クリック: 152回この商品を含むブログ (9件) を見る林先生に大分前にお薦めされて買った本。やっと主要な部分（7…
大分前に，東大でシンポがあったときに，著者割で購入した久保さんの本。サインも頂いときました。なかなか読まないのでアメリカに持ってきたのですが，やっと読み始めました。メモを適宜残していきたいと思います。読了前から言えることは，とにかくお薦め…
Forfait-Dubuc et al. 2012. Survival data analyses in ecotoxicology: critical effect concentrations, methods and models. What should we use? Ecotoxicology 21:1072-1083. 生存データに対して，複数のモデルを使って，NOEC, LC5, NECを比較した論文…
OECD. 2006. Current approaches in the statistical analysis of ecotoxicity data: a guidance to application Organisation for Economic Cooperation and Development, Paris, France. p.13 Ecotoxicity tests are biological experiments performed to …
ポアソン分布のGLMで過分散になった場合に，いくつか大体の分布を使うというのが1つの方法だと思います*1。そんなときに，代表的に使われるのが，負の二項分布，疑似ポアソン*2。どっちがええん？という問題があるのですが，答えは，「There is no general a…
ブートストラップ入門 (Rで学ぶデータサイエンス 4)作者: 汪金芳,桜井裕仁,金明哲出版社/メーカー: 共立出版発売日: 2011/12/21メディア: 単行本 クリック: 24回この商品を含むブログ (4件) を見る（以下，正確性にあまり自信はないです） ブートストラップ…
モデル選択本*1の，David Andersonの一日ショートコースを受けてきました。まぁ基本的に知っている話題だったので，個人的には大体理解できたように思います。すごく分かりやすい講義をされていましたし（QAICの話はここでしなくてもって感じでしたが）。基…
Green J.W., Springer T.A., Staveley J.P. (in press) The drive to ban the NOEC/LOEC in favor of ECx is misguided and misinformed. Integr. Environ. Assess. Manag. NOECやLOECを禁止しようというLandisとChapmanの論考に対する反論論文（Short Commu…
