Beaudouin R, Dias V, Bonzom JM, Pery A. 2012. Individual-based model of Chironomus riparius population dynamics over several generations to explore adaptation following exposure to uranium-spiked sediments. Ecotoxicology 21:1225-1239.
ユスリカのIBM(個体ベースモデル)。著者の一人から論文別刷り下さいメールをもらったので,読んでみた。モデルの記述はさっと飛ばして,結果以降をざら読み。おもしろいと思うし,ちゃんと実験もしていて良い感じだと思うんだけど,accuratelyの使い方が結構ざっとしてたりとか,「emergence rateが増加してますよね」的なところの根拠がわかんなかったりとか*1,図の縦軸の意味がほんとにこれでいいの?と思ったりとか*2,うーん,と思うところも複数箇所あり*3。Grimmさんの以下の論文たちは参考になりそう。
Grimm et al. 2006. A standard protocol for describing individual-based and agent-based models. Ecol Model 198:115-126.
Grimm et al. 2010. The ODD protocol: A review and first update. Ecol Model 221:2760-2768.