separationってなんですか？R-helpとかを見るに，その状況に該当するようですが，解決策がよくわからない。
とりあえず，よくわからないのですが。ここによると，"get more data"というのが結論らしい。
###追記20090717
どうやら，ここによると，penalized maximum likelihood in brglmを使えばうまくいくとのこと。とりあえず，整理のみ（まだ中身は理解はしてません）。
> s0b <- glm(cbind(ys,yd)~xs,family=binomial(link=logit))
Warning messages:
1: In glm.fit(x = X, y = Y, weights = weights, start = start, etastart = etastart, :
アルゴリズムは収束しませんでした
2: In glm.fit(x = X, y = Y, weights = weights, start = start, etastart = etastart, :
数値的に 0 か 1 である確率が生じました
## 追記 2013/01/17
需要があるかわかりませんが，brglm関連で，一応メモしておきます。
NKMRさんから教えてもらったのですが，Separationが何かという点については，以下のリンク先が分かりやすいかもしれません（後半にseparationのデータを使った解析が出ています*1）。
http://www.wekaleamstudios.co.uk/posts/logistic-regression-and-bias-reduction/
brglmの結果を多重比較したい場合に，出力結果をlibrary(multcomp)に使ってよいか？という疑問*2。brglmの作者であるIoannisに問合せてみたところ，no problemということでした。多分良さそうな気はしていたのですが，helpにAICを使う事に対する注意が書いてあったので，気になった次第です。
とりあえず以上。
## 追記 2013/02/20
Nakamori, T. and N. Kaneko. 2013. Biomarker responses reveal that food quality affects cadmium exposure in the soil collembolan Folsomia candida. Environmental Pollution 176:165-170.
brglmを使った中森さんの論文です。餌の質をかえてやると，トビムシのカドミウムの曝露量（バイオマーカーで代替）が変わるというお話*3。水系ではあまり出てこない話なので，あまり考えたことなかったけど，おもしろいお話。
